初めて自作PCを組むのでアドバイスを下さい。（げろさぶさん）

860→870
GF9800ならGE430とかRadeon5650とかのがいいと思います

その満足してないPCのスペックと具体的な不満を書かないと。

あと3週間で新型CPUが出ます。SATA 6Gbpsへの対応も有るので出来れば待ったほうがいいです。

値段が出ないのはディスコンだと思いますけど。

グラボはどの程度のゲームまでやるかによるけど、色んなゲームが出来て、重いのはそこそこ動けばいいというならGTX460 1GB版 (非SE版) をお勧め。
動画や絵はCUDAでアクセラレートされるものもあるのでRADEONはお勧めしない。(折角ミドルクラス買うなら)

DVDはそんなに高いの要らないのでは?

ウイルススキャンだけなら無料もあります。

CPUは今ならi7-860よりはほぼ同じ価格で買えるi7-870が良いかと思います。
少し待てるのなら年明けにSandyシリーズが出ますので
そちらも検討してみてはと思います。

グラボの9800GTGEは古すぎてもう手に入らないかもしれません。
価格帯的にはHD5670〜HD5770、GT240ぐらいでしょけど電源次第では
型落ちでコストパフォーマンスが非常に良くなっているHD5850なども候補として良いでしょう。
Radeonでも動画支援は効きますし、OfficeやフォトショCS・イラレといったソフトでも
GPUアクセラレートはちゃんと効きますので。

電源の550VXJPは一部ロットで相性問題が出ていましたのでできれば回避。
無難なところではEA-650が同価格帯としてはいいかと思います。

＞今回考えるPCで「○○のほうが評価、性能が良い」などをアドバイスしてくださると幸いです。

すでに価格がない製品・生産終了の製品を選択しているのはなぜ？
性能が良いというのは、何を比較した話ですか？
消費電力ですか？何かのベンチマークですか？
i7　950とGA-X58-USB3 Rev.1.0がよいのでは？